Jest to zapalenie błony śluzowej żołądka i dwunastnicy głównie za sprawą bakterii Helicobacter pylori.
Bakteria ta może spowodować zanik błony śluzowej, nadżerkę lub wewnętrzny krwotok. Bakteria Helicobacter pylori jest bardzo ruchliwą bakterią przez co szybko przenika do komórek w błonie śluzowej żołądka, mocno do nich przylegając.